Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL4

Mrpl20, 39S ribosomal protein L20, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl20Q9CQL4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl20Q9CQL4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl20Q9CQL4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl20Q9CQL4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl20Q9CQL4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl20Q9CQL4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl20Q9CQL4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms