Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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