Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 837.4 ms