Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ2

Trim11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim11Q99PQ2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim11Q99PQ2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim11Q99PQ2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim11Q99PQ2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim11Q99PQ2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim11Q99PQ2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim11Q99PQ2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim11Q99PQ2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim11Q99PQ2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim11Q99PQ2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim11Q99PQ2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim11Q99PQ2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim11Q99PQ2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim11Q99PQ2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim11Q99PQ2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Trim11Q99PQ2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim11Q99PQ2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim11Q99PQ2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim11Q99PQ2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim11Q99PQ2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim11Q99PQ2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim11Q99PQ2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim11Q99PQ2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim11Q99PQ2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim11Q99PQ2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim11Q99PQ2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim11Q99PQ2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim11Q99PQ2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim11Q99PQ2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim11Q99PQ2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim11Q99PQ2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim11Q99PQ2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim11Q99PQ2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim11Q99PQ2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim11Q99PQ2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim11Q99PQ2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim11Q99PQ2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim11Q99PQ2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim11Q99PQ2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim11Q99PQ2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim11Q99PQ2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim11Q99PQ2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim11Q99PQ2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim11Q99PQ2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim11Q99PQ2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim11Q99PQ2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim11Q99PQ2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim11Q99PQ2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim11Q99PQ2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim11Q99PQ2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim11Q99PQ2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim11Q99PQ2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim11Q99PQ2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim11Q99PQ2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim11Q99PQ2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim11Q99PQ2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim11Q99PQ2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim11Q99PQ2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim11Q99PQ2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim11Q99PQ2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim11Q99PQ2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim11Q99PQ2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trim11Q99PQ2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trim11Q99PQ2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trim11Q99PQ2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim11Q99PQ2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms