Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Rrbp1Q99PL5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Rrbp1Q99PL5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Rrbp1Q99PL5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Rrbp1Q99PL5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Rrbp1Q99PL5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Rrbp1Q99PL5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Rrbp1Q99PL5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Rrbp1Q99PL5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Rrbp1Q99PL5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Rrbp1Q99PL5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Rrbp1Q99PL5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Rrbp1Q99PL5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Rrbp1Q99PL5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Rrbp1Q99PL5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Rrbp1Q99PL5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Rrbp1Q99PL5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Rrbp1Q99PL5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Rrbp1Q99PL5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Rrbp1Q99PL5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Rrbp1Q99PL5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Rrbp1Q99PL5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Rrbp1Q99PL5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Rrbp1Q99PL5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Rrbp1Q99PL5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Rrbp1Q99PL5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Rrbp1Q99PL5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Rrbp1Q99PL5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Rrbp1Q99PL5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Rrbp1Q99PL5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Rrbp1Q99PL5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Rrbp1Q99PL5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Rrbp1Q99PL5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Rrbp1Q99PL5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Rrbp1Q99PL5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Rrbp1Q99PL5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Rrbp1Q99PL5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Rrbp1Q99PL5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Rrbp1Q99PL5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Rrbp1Q99PL5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Rrbp1Q99PL5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Rrbp1Q99PL5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Rrbp1Q99PL5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Rrbp1Q99PL5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Rrbp1Q99PL5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Rrbp1Q99PL5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Rrbp1Q99PL5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Rrbp1Q99PL5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Rrbp1Q99PL5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Rrbp1Q99PL5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Rrbp1Q99PL5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Rrbp1Q99PL5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Rrbp1Q99PL5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Rrbp1Q99PL5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Rrbp1Q99PL5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Rrbp1Q99PL5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Rrbp1Q99PL5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Rrbp1Q99PL5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Rrbp1Q99PL5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Rrbp1Q99PL5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rrbp1Q99PL5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rrbp1Q99PL5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rrbp1Q99PL5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rrbp1Q99PL5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rrbp1Q99PL5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rrbp1Q99PL5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rrbp1Q99PL5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rrbp1Q99PL5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rrbp1Q99PL5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Rrbp1Q99PL5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Rrbp1Q99PL5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Rrbp1Q99PL5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rrbp1Q99PL5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rrbp1Q99PL5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rrbp1Q99PL5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rrbp1Q99PL5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rrbp1Q99PL5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rrbp1Q99PL5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rrbp1Q99PL5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rrbp1Q99PL5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rrbp1Q99PL5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rrbp1Q99PL5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Rrbp1Q99PL5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rrbp1Q99PL5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rrbp1Q99PL5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rrbp1Q99PL5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rrbp1Q99PL5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rrbp1Q99PL5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rrbp1Q99PL5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rrbp1Q99PL5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rrbp1Q99PL5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rrbp1Q99PL5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Rrbp1Q99PL5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Rrbp1Q99PL5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Rrbp1Q99PL5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rrbp1Q99PL5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rrbp1Q99PL5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Rrbp1Q99PL5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rrbp1Q99PL5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rrbp1Q99PL5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms