Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rtn4Q99P72 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rtn4Q99P72 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rtn4Q99P72 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rtn4Q99P72 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rtn4Q99P72 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rtn4Q99P72 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rtn4Q99P72 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rtn4Q99P72 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rtn4Q99P72 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Rtn4Q99P72 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rtn4Q99P72 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rtn4Q99P72 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rtn4Q99P72 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rtn4Q99P72 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rtn4Q99P72 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rtn4Q99P72 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rtn4Q99P72 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rtn4Q99P72 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rtn4Q99P72 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rtn4Q99P72 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rtn4Q99P72 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rtn4Q99P72 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtn4Q99P72 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtn4Q99P72 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtn4Q99P72 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtn4Q99P72 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtn4Q99P72 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtn4Q99P72 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtn4Q99P72 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtn4Q99P72 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtn4Q99P72 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rtn4Q99P72 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rtn4Q99P72 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rtn4Q99P72 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rtn4Q99P72 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rtn4Q99P72 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rtn4Q99P72 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rtn4Q99P72 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rtn4Q99P72 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rtn4Q99P72 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rtn4Q99P72 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rtn4Q99P72 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rtn4Q99P72 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rtn4Q99P72 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rtn4Q99P72 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rtn4Q99P72 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rtn4Q99P72 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rtn4Q99P72 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rtn4Q99P72 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rtn4Q99P72 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rtn4Q99P72 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rtn4Q99P72 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rtn4Q99P72 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rtn4Q99P72 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rtn4Q99P72 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rtn4Q99P72 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rtn4Q99P72 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rtn4Q99P72 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rtn4Q99P72 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rtn4Q99P72 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rtn4Q99P72 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rtn4Q99P72 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rtn4Q99P72 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rtn4Q99P72 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rtn4Q99P72 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rtn4Q99P72 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rtn4Q99P72 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rtn4Q99P72 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rtn4Q99P72 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rtn4Q99P72 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rtn4Q99P72 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rtn4Q99P72 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rtn4Q99P72 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rtn4Q99P72 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rtn4Q99P72 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rtn4Q99P72 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rtn4Q99P72 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rtn4Q99P72 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rtn4Q99P72 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rtn4Q99P72 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rtn4Q99P72 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rtn4Q99P72 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rtn4Q99P72 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Rtn4Q99P72 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rtn4Q99P72 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rtn4Q99P72 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rtn4Q99P72 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rtn4Q99P72 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rtn4Q99P72 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rtn4Q99P72 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rtn4Q99P72 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rtn4Q99P72 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rtn4Q99P72 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rtn4Q99P72 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rtn4Q99P72 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rtn4Q99P72 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rtn4Q99P72 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rtn4Q99P72 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rtn4Q99P72 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 868.5 ms