Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tdrd1Q99MV1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tdrd1Q99MV1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tdrd1Q99MV1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tdrd1Q99MV1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tdrd1Q99MV1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tdrd1Q99MV1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tdrd1Q99MV1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tdrd1Q99MV1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tdrd1Q99MV1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tdrd1Q99MV1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tdrd1Q99MV1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tdrd1Q99MV1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tdrd1Q99MV1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tdrd1Q99MV1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tdrd1Q99MV1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tdrd1Q99MV1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tdrd1Q99MV1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tdrd1Q99MV1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tdrd1Q99MV1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tdrd1Q99MV1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd1Q99MV1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd1Q99MV1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tdrd1Q99MV1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tdrd1Q99MV1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tdrd1Q99MV1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tdrd1Q99MV1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tdrd1Q99MV1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tdrd1Q99MV1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tdrd1Q99MV1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tdrd1Q99MV1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tdrd1Q99MV1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tdrd1Q99MV1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tdrd1Q99MV1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tdrd1Q99MV1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tdrd1Q99MV1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tdrd1Q99MV1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tdrd1Q99MV1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tdrd1Q99MV1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tdrd1Q99MV1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tdrd1Q99MV1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tdrd1Q99MV1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tdrd1Q99MV1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tdrd1Q99MV1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Tdrd1Q99MV1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tdrd1Q99MV1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tdrd1Q99MV1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd1Q99MV1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd1Q99MV1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd1Q99MV1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd1Q99MV1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd1Q99MV1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd1Q99MV1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tdrd1Q99MV1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tdrd1Q99MV1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tdrd1Q99MV1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tdrd1Q99MV1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tdrd1Q99MV1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tdrd1Q99MV1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tdrd1Q99MV1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tdrd1Q99MV1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tdrd1Q99MV1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tdrd1Q99MV1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tdrd1Q99MV1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tdrd1Q99MV1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tdrd1Q99MV1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tdrd1Q99MV1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tdrd1Q99MV1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tdrd1Q99MV1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Tdrd1Q99MV1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tdrd1Q99MV1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tdrd1Q99MV1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tdrd1Q99MV1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tdrd1Q99MV1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tdrd1Q99MV1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Tdrd1Q99MV1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tdrd1Q99MV1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tdrd1Q99MV1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tdrd1Q99MV1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tdrd1Q99MV1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tdrd1Q99MV1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tdrd1Q99MV1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tdrd1Q99MV1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tdrd1Q99MV1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tdrd1Q99MV1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tdrd1Q99MV1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tdrd1Q99MV1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tdrd1Q99MV1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tdrd1Q99MV1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tdrd1Q99MV1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tdrd1Q99MV1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tdrd1Q99MV1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tdrd1Q99MV1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tdrd1Q99MV1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tdrd1Q99MV1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tdrd1Q99MV1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tdrd1Q99MV1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tdrd1Q99MV1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tdrd1Q99MV1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tdrd1Q99MV1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms