Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SncaipQ99ME3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SncaipQ99ME3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SncaipQ99ME3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SncaipQ99ME3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SncaipQ99ME3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SncaipQ99ME3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SncaipQ99ME3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SncaipQ99ME3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SncaipQ99ME3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SncaipQ99ME3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SncaipQ99ME3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SncaipQ99ME3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SncaipQ99ME3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SncaipQ99ME3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SncaipQ99ME3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SncaipQ99ME3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SncaipQ99ME3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SncaipQ99ME3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SncaipQ99ME3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SncaipQ99ME3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SncaipQ99ME3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SncaipQ99ME3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SncaipQ99ME3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SncaipQ99ME3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SncaipQ99ME3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SncaipQ99ME3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SncaipQ99ME3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SncaipQ99ME3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SncaipQ99ME3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SncaipQ99ME3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SncaipQ99ME3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SncaipQ99ME3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SncaipQ99ME3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SncaipQ99ME3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SncaipQ99ME3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SncaipQ99ME3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SncaipQ99ME3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SncaipQ99ME3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SncaipQ99ME3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SncaipQ99ME3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SncaipQ99ME3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SncaipQ99ME3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SncaipQ99ME3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SncaipQ99ME3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SncaipQ99ME3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SncaipQ99ME3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SncaipQ99ME3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SncaipQ99ME3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SncaipQ99ME3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SncaipQ99ME3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SncaipQ99ME3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SncaipQ99ME3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SncaipQ99ME3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SncaipQ99ME3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SncaipQ99ME3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SncaipQ99ME3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SncaipQ99ME3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SncaipQ99ME3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SncaipQ99ME3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SncaipQ99ME3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SncaipQ99ME3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SncaipQ99ME3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SncaipQ99ME3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SncaipQ99ME3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SncaipQ99ME3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SncaipQ99ME3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SncaipQ99ME3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SncaipQ99ME3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SncaipQ99ME3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SncaipQ99ME3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SncaipQ99ME3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SncaipQ99ME3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SncaipQ99ME3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SncaipQ99ME3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SncaipQ99ME3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SncaipQ99ME3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SncaipQ99ME3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SncaipQ99ME3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SncaipQ99ME3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SncaipQ99ME3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SncaipQ99ME3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SncaipQ99ME3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SncaipQ99ME3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SncaipQ99ME3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SncaipQ99ME3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SncaipQ99ME3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SncaipQ99ME3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SncaipQ99ME3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SncaipQ99ME3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SncaipQ99ME3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SncaipQ99ME3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SncaipQ99ME3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SncaipQ99ME3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SncaipQ99ME3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SncaipQ99ME3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SncaipQ99ME3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SncaipQ99ME3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SncaipQ99ME3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SncaipQ99ME3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms