Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tlr3Q99MB1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tlr3Q99MB1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tlr3Q99MB1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tlr3Q99MB1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tlr3Q99MB1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tlr3Q99MB1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tlr3Q99MB1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tlr3Q99MB1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tlr3Q99MB1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tlr3Q99MB1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tlr3Q99MB1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tlr3Q99MB1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tlr3Q99MB1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tlr3Q99MB1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tlr3Q99MB1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tlr3Q99MB1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tlr3Q99MB1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tlr3Q99MB1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tlr3Q99MB1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tlr3Q99MB1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tlr3Q99MB1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tlr3Q99MB1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tlr3Q99MB1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tlr3Q99MB1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tlr3Q99MB1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tlr3Q99MB1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tlr3Q99MB1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tlr3Q99MB1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tlr3Q99MB1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tlr3Q99MB1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tlr3Q99MB1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tlr3Q99MB1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr3Q99MB1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr3Q99MB1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr3Q99MB1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr3Q99MB1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr3Q99MB1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr3Q99MB1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr3Q99MB1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr3Q99MB1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr3Q99MB1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr3Q99MB1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr3Q99MB1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlr3Q99MB1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlr3Q99MB1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlr3Q99MB1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tlr3Q99MB1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tlr3Q99MB1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr3Q99MB1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr3Q99MB1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr3Q99MB1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr3Q99MB1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr3Q99MB1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr3Q99MB1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tlr3Q99MB1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tlr3Q99MB1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tlr3Q99MB1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tlr3Q99MB1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tlr3Q99MB1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlr3Q99MB1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlr3Q99MB1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlr3Q99MB1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tlr3Q99MB1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tlr3Q99MB1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlr3Q99MB1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlr3Q99MB1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlr3Q99MB1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlr3Q99MB1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlr3Q99MB1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms