Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmtm3Q99LJ5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm3Q99LJ5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms