Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sh3bp5lQ99LH9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sh3bp5lQ99LH9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sh3bp5lQ99LH9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Sh3bp5lQ99LH9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sh3bp5lQ99LH9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sh3bp5lQ99LH9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Sh3bp5lQ99LH9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sh3bp5lQ99LH9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Sh3bp5lQ99LH9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sh3bp5lQ99LH9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Sh3bp5lQ99LH9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sh3bp5lQ99LH9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sh3bp5lQ99LH9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Sh3bp5lQ99LH9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sh3bp5lQ99LH9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sh3bp5lQ99LH9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sh3bp5lQ99LH9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sh3bp5lQ99LH9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sh3bp5lQ99LH9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sh3bp5lQ99LH9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sh3bp5lQ99LH9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sh3bp5lQ99LH9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sh3bp5lQ99LH9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sh3bp5lQ99LH9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sh3bp5lQ99LH9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sh3bp5lQ99LH9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sh3bp5lQ99LH9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sh3bp5lQ99LH9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sh3bp5lQ99LH9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sh3bp5lQ99LH9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sh3bp5lQ99LH9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sh3bp5lQ99LH9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sh3bp5lQ99LH9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sh3bp5lQ99LH9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sh3bp5lQ99LH9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sh3bp5lQ99LH9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sh3bp5lQ99LH9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sh3bp5lQ99LH9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sh3bp5lQ99LH9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sh3bp5lQ99LH9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sh3bp5lQ99LH9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sh3bp5lQ99LH9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sh3bp5lQ99LH9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sh3bp5lQ99LH9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sh3bp5lQ99LH9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sh3bp5lQ99LH9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sh3bp5lQ99LH9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sh3bp5lQ99LH9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sh3bp5lQ99LH9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sh3bp5lQ99LH9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sh3bp5lQ99LH9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sh3bp5lQ99LH9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sh3bp5lQ99LH9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sh3bp5lQ99LH9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sh3bp5lQ99LH9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Sh3bp5lQ99LH9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sh3bp5lQ99LH9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sh3bp5lQ99LH9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sh3bp5lQ99LH9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sh3bp5lQ99LH9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sh3bp5lQ99LH9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sh3bp5lQ99LH9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sh3bp5lQ99LH9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sh3bp5lQ99LH9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sh3bp5lQ99LH9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sh3bp5lQ99LH9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sh3bp5lQ99LH9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sh3bp5lQ99LH9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sh3bp5lQ99LH9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sh3bp5lQ99LH9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sh3bp5lQ99LH9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sh3bp5lQ99LH9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sh3bp5lQ99LH9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sh3bp5lQ99LH9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sh3bp5lQ99LH9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Sh3bp5lQ99LH9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sh3bp5lQ99LH9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sh3bp5lQ99LH9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Sh3bp5lQ99LH9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sh3bp5lQ99LH9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
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