Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lysmd3Q99LE3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lysmd3Q99LE3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lysmd3Q99LE3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lysmd3Q99LE3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lysmd3Q99LE3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lysmd3Q99LE3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lysmd3Q99LE3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lysmd3Q99LE3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lysmd3Q99LE3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lysmd3Q99LE3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lysmd3Q99LE3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lysmd3Q99LE3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lysmd3Q99LE3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lysmd3Q99LE3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lysmd3Q99LE3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lysmd3Q99LE3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lysmd3Q99LE3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lysmd3Q99LE3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lysmd3Q99LE3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lysmd3Q99LE3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lysmd3Q99LE3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lysmd3Q99LE3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lysmd3Q99LE3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lysmd3Q99LE3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lysmd3Q99LE3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lysmd3Q99LE3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lysmd3Q99LE3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lysmd3Q99LE3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lysmd3Q99LE3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lysmd3Q99LE3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lysmd3Q99LE3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lysmd3Q99LE3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Lysmd3Q99LE3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lysmd3Q99LE3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms