Protein–RNA interactions for Protein: Q99J21

Mcoln1, Mucolipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln1Q99J21 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcoln1Q99J21 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcoln1Q99J21 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcoln1Q99J21 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mcoln1Q99J21 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Mcoln1Q99J21 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Mcoln1Q99J21 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Mcoln1Q99J21 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Mcoln1Q99J21 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Mcoln1Q99J21 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mcoln1Q99J21 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mcoln1Q99J21 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mcoln1Q99J21 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mcoln1Q99J21 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mcoln1Q99J21 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mcoln1Q99J21 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mcoln1Q99J21 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Mcoln1Q99J21 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mcoln1Q99J21 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mcoln1Q99J21 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mcoln1Q99J21 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mcoln1Q99J21 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mcoln1Q99J21 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mcoln1Q99J21 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mcoln1Q99J21 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mcoln1Q99J21 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mcoln1Q99J21 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mcoln1Q99J21 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mcoln1Q99J21 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mcoln1Q99J21 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mcoln1Q99J21 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mcoln1Q99J21 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mcoln1Q99J21 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mcoln1Q99J21 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mcoln1Q99J21 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mcoln1Q99J21 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Mcoln1Q99J21 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mcoln1Q99J21 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mcoln1Q99J21 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mcoln1Q99J21 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mcoln1Q99J21 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mcoln1Q99J21 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mcoln1Q99J21 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mcoln1Q99J21 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Mcoln1Q99J21 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcoln1Q99J21 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcoln1Q99J21 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcoln1Q99J21 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcoln1Q99J21 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcoln1Q99J21 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcoln1Q99J21 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcoln1Q99J21 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcoln1Q99J21 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcoln1Q99J21 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mcoln1Q99J21 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mcoln1Q99J21 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mcoln1Q99J21 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mcoln1Q99J21 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mcoln1Q99J21 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Mcoln1Q99J21 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mcoln1Q99J21 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mcoln1Q99J21 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mcoln1Q99J21 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mcoln1Q99J21 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mcoln1Q99J21 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mcoln1Q99J21 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mcoln1Q99J21 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mcoln1Q99J21 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mcoln1Q99J21 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Mcoln1Q99J21 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mcoln1Q99J21 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mcoln1Q99J21 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mcoln1Q99J21 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mcoln1Q99J21 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mcoln1Q99J21 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mcoln1Q99J21 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mcoln1Q99J21 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mcoln1Q99J21 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mcoln1Q99J21 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mcoln1Q99J21 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mcoln1Q99J21 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mcoln1Q99J21 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mcoln1Q99J21 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mcoln1Q99J21 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mcoln1Q99J21 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mcoln1Q99J21 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mcoln1Q99J21 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Mcoln1Q99J21 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mcoln1Q99J21 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mcoln1Q99J21 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mcoln1Q99J21 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mcoln1Q99J21 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mcoln1Q99J21 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mcoln1Q99J21 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mcoln1Q99J21 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mcoln1Q99J21 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mcoln1Q99J21 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mcoln1Q99J21 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mcoln1Q99J21 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mcoln1Q99J21 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms