Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn1Q922Y1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ubxn1Q922Y1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ubxn1Q922Y1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn1Q922Y1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ubxn1Q922Y1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn1Q922Y1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms