Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Clip1Q922J3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Clip1Q922J3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Clip1Q922J3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Clip1Q922J3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Clip1Q922J3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Clip1Q922J3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Clip1Q922J3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Clip1Q922J3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Clip1Q922J3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Clip1Q922J3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Clip1Q922J3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Clip1Q922J3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Clip1Q922J3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Clip1Q922J3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Clip1Q922J3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Clip1Q922J3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Clip1Q922J3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Clip1Q922J3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Clip1Q922J3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Clip1Q922J3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Clip1Q922J3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Clip1Q922J3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Clip1Q922J3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Clip1Q922J3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Clip1Q922J3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Clip1Q922J3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Clip1Q922J3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Clip1Q922J3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Clip1Q922J3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Clip1Q922J3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Clip1Q922J3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Clip1Q922J3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Clip1Q922J3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Clip1Q922J3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Clip1Q922J3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Clip1Q922J3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Clip1Q922J3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Clip1Q922J3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Clip1Q922J3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Clip1Q922J3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Clip1Q922J3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Clip1Q922J3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Clip1Q922J3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Clip1Q922J3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Clip1Q922J3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Clip1Q922J3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Clip1Q922J3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Clip1Q922J3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Clip1Q922J3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Clip1Q922J3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Clip1Q922J3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Clip1Q922J3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Clip1Q922J3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Clip1Q922J3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Clip1Q922J3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Clip1Q922J3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Clip1Q922J3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Clip1Q922J3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Clip1Q922J3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Clip1Q922J3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Clip1Q922J3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Clip1Q922J3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Clip1Q922J3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Clip1Q922J3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Clip1Q922J3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Clip1Q922J3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Clip1Q922J3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms