Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Supt16hQ920B9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Supt16hQ920B9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt16hQ920B9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt16hQ920B9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt16hQ920B9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt16hQ920B9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Supt16hQ920B9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Supt16hQ920B9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Supt16hQ920B9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Supt16hQ920B9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Supt16hQ920B9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Supt16hQ920B9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Supt16hQ920B9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Supt16hQ920B9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Supt16hQ920B9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Supt16hQ920B9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Supt16hQ920B9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Supt16hQ920B9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Supt16hQ920B9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Supt16hQ920B9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Supt16hQ920B9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Supt16hQ920B9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Supt16hQ920B9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Supt16hQ920B9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Supt16hQ920B9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Supt16hQ920B9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Supt16hQ920B9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Supt16hQ920B9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Supt16hQ920B9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Supt16hQ920B9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Supt16hQ920B9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Supt16hQ920B9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Supt16hQ920B9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Supt16hQ920B9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Supt16hQ920B9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Supt16hQ920B9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Supt16hQ920B9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Supt16hQ920B9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Supt16hQ920B9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Supt16hQ920B9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Supt16hQ920B9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Supt16hQ920B9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Supt16hQ920B9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Supt16hQ920B9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Supt16hQ920B9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Supt16hQ920B9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Supt16hQ920B9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Supt16hQ920B9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Supt16hQ920B9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Supt16hQ920B9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Supt16hQ920B9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Supt16hQ920B9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Supt16hQ920B9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Supt16hQ920B9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Supt16hQ920B9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Supt16hQ920B9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Supt16hQ920B9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Supt16hQ920B9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Supt16hQ920B9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Supt16hQ920B9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Supt16hQ920B9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Supt16hQ920B9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Supt16hQ920B9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Supt16hQ920B9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Supt16hQ920B9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Supt16hQ920B9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Supt16hQ920B9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Supt16hQ920B9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Supt16hQ920B9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Supt16hQ920B9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Supt16hQ920B9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Supt16hQ920B9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Supt16hQ920B9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Supt16hQ920B9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Supt16hQ920B9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Supt16hQ920B9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Supt16hQ920B9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Supt16hQ920B9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Supt16hQ920B9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Supt16hQ920B9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Supt16hQ920B9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Supt16hQ920B9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Supt16hQ920B9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Supt16hQ920B9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt16hQ920B9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt16hQ920B9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt16hQ920B9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt16hQ920B9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt16hQ920B9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Supt16hQ920B9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Supt16hQ920B9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Supt16hQ920B9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Supt16hQ920B9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Supt16hQ920B9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Supt16hQ920B9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Supt16hQ920B9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Supt16hQ920B9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Supt16hQ920B9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Supt16hQ920B9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms