Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Afg3l1Q920A7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Afg3l1Q920A7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Afg3l1Q920A7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Afg3l1Q920A7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Afg3l1Q920A7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Afg3l1Q920A7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Afg3l1Q920A7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Afg3l1Q920A7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Afg3l1Q920A7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Afg3l1Q920A7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Afg3l1Q920A7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Afg3l1Q920A7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Afg3l1Q920A7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Afg3l1Q920A7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Afg3l1Q920A7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Afg3l1Q920A7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Afg3l1Q920A7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Afg3l1Q920A7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Afg3l1Q920A7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Afg3l1Q920A7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Afg3l1Q920A7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Afg3l1Q920A7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Afg3l1Q920A7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Afg3l1Q920A7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Afg3l1Q920A7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Afg3l1Q920A7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Afg3l1Q920A7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Afg3l1Q920A7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Afg3l1Q920A7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Afg3l1Q920A7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Afg3l1Q920A7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Afg3l1Q920A7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Afg3l1Q920A7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Afg3l1Q920A7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Afg3l1Q920A7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Afg3l1Q920A7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Afg3l1Q920A7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Afg3l1Q920A7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Afg3l1Q920A7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Afg3l1Q920A7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Afg3l1Q920A7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Afg3l1Q920A7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Afg3l1Q920A7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Afg3l1Q920A7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Afg3l1Q920A7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Afg3l1Q920A7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Afg3l1Q920A7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Afg3l1Q920A7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Afg3l1Q920A7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Afg3l1Q920A7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Afg3l1Q920A7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Afg3l1Q920A7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Afg3l1Q920A7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Afg3l1Q920A7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Afg3l1Q920A7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Afg3l1Q920A7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Afg3l1Q920A7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Afg3l1Q920A7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms