Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y19

Pcdha11, Protocadherin alpha 11, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha11Q91Y19 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha11Q91Y19 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha11Q91Y19 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha11Q91Y19 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha11Q91Y19 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha11Q91Y19 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha11Q91Y19 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha11Q91Y19 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha11Q91Y19 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha11Q91Y19 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha11Q91Y19 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha11Q91Y19 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha11Q91Y19 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha11Q91Y19 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha11Q91Y19 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha11Q91Y19 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha11Q91Y19 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha11Q91Y19 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha11Q91Y19 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha11Q91Y19 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha11Q91Y19 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha11Q91Y19 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha11Q91Y19 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha11Q91Y19 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pcdha11Q91Y19 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha11Q91Y19 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha11Q91Y19 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha11Q91Y19 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha11Q91Y19 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha11Q91Y19 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha11Q91Y19 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha11Q91Y19 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha11Q91Y19 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha11Q91Y19 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha11Q91Y19 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha11Q91Y19 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha11Q91Y19 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha11Q91Y19 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha11Q91Y19 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha11Q91Y19 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha11Q91Y19 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha11Q91Y19 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha11Q91Y19 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha11Q91Y19 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha11Q91Y19 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha11Q91Y19 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha11Q91Y19 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha11Q91Y19 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha11Q91Y19 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha11Q91Y19 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdha11Q91Y19 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdha11Q91Y19 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdha11Q91Y19 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdha11Q91Y19 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdha11Q91Y19 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha11Q91Y19 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha11Q91Y19 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha11Q91Y19 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha11Q91Y19 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha11Q91Y19 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha11Q91Y19 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha11Q91Y19 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha11Q91Y19 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha11Q91Y19 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha11Q91Y19 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha11Q91Y19 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha11Q91Y19 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha11Q91Y19 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha11Q91Y19 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha11Q91Y19 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha11Q91Y19 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha11Q91Y19 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha11Q91Y19 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha11Q91Y19 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha11Q91Y19 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha11Q91Y19 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha11Q91Y19 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha11Q91Y19 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha11Q91Y19 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.8 ms