Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y15

Pcdha5, Protocadherin alpha 5, mousemouse

Predictions only

Length 934 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha5Q91Y15 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha5Q91Y15 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha5Q91Y15 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha5Q91Y15 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha5Q91Y15 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha5Q91Y15 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha5Q91Y15 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha5Q91Y15 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha5Q91Y15 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha5Q91Y15 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha5Q91Y15 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha5Q91Y15 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha5Q91Y15 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha5Q91Y15 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha5Q91Y15 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha5Q91Y15 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha5Q91Y15 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha5Q91Y15 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha5Q91Y15 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha5Q91Y15 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha5Q91Y15 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha5Q91Y15 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha5Q91Y15 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha5Q91Y15 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha5Q91Y15 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcdha5Q91Y15 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha5Q91Y15 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha5Q91Y15 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha5Q91Y15 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha5Q91Y15 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha5Q91Y15 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha5Q91Y15 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha5Q91Y15 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha5Q91Y15 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha5Q91Y15 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha5Q91Y15 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha5Q91Y15 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha5Q91Y15 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha5Q91Y15 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha5Q91Y15 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha5Q91Y15 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha5Q91Y15 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha5Q91Y15 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha5Q91Y15 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha5Q91Y15 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha5Q91Y15 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha5Q91Y15 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha5Q91Y15 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha5Q91Y15 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha5Q91Y15 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha5Q91Y15 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha5Q91Y15 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms