Protein–RNA interactions for Protein: Q91UZ8

Pcdhb11, MCG141285, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb11Q91UZ8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhb11Q91UZ8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb11Q91UZ8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb11Q91UZ8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb11Q91UZ8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb11Q91UZ8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb11Q91UZ8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb11Q91UZ8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb11Q91UZ8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb11Q91UZ8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb11Q91UZ8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb11Q91UZ8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb11Q91UZ8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb11Q91UZ8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb11Q91UZ8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb11Q91UZ8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb11Q91UZ8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb11Q91UZ8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb11Q91UZ8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb11Q91UZ8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb11Q91UZ8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb11Q91UZ8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb11Q91UZ8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb11Q91UZ8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb11Q91UZ8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb11Q91UZ8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb11Q91UZ8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb11Q91UZ8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb11Q91UZ8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb11Q91UZ8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb11Q91UZ8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb11Q91UZ8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb11Q91UZ8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb11Q91UZ8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb11Q91UZ8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb11Q91UZ8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb11Q91UZ8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb11Q91UZ8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb11Q91UZ8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb11Q91UZ8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb11Q91UZ8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb11Q91UZ8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb11Q91UZ8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb11Q91UZ8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb11Q91UZ8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb11Q91UZ8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb11Q91UZ8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb11Q91UZ8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb11Q91UZ8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb11Q91UZ8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pcdhb11Q91UZ8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb11Q91UZ8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb11Q91UZ8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb11Q91UZ8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb11Q91UZ8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb11Q91UZ8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb11Q91UZ8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb11Q91UZ8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb11Q91UZ8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb11Q91UZ8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb11Q91UZ8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb11Q91UZ8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb11Q91UZ8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb11Q91UZ8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb11Q91UZ8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb11Q91UZ8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb11Q91UZ8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb11Q91UZ8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb11Q91UZ8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb11Q91UZ8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb11Q91UZ8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb11Q91UZ8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb11Q91UZ8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb11Q91UZ8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb11Q91UZ8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb11Q91UZ8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb11Q91UZ8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdhb11Q91UZ8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1379.6 ms