Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHS2

Crb1, Protein crumbs homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb1Q8VHS2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Crb1Q8VHS2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Crb1Q8VHS2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Crb1Q8VHS2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Crb1Q8VHS2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Crb1Q8VHS2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Crb1Q8VHS2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Crb1Q8VHS2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Crb1Q8VHS2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Crb1Q8VHS2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Crb1Q8VHS2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Crb1Q8VHS2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Crb1Q8VHS2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Crb1Q8VHS2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Crb1Q8VHS2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Crb1Q8VHS2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Crb1Q8VHS2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Crb1Q8VHS2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Crb1Q8VHS2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Crb1Q8VHS2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Crb1Q8VHS2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Crb1Q8VHS2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Crb1Q8VHS2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Crb1Q8VHS2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Crb1Q8VHS2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Crb1Q8VHS2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Crb1Q8VHS2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Crb1Q8VHS2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Crb1Q8VHS2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Crb1Q8VHS2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Crb1Q8VHS2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Crb1Q8VHS2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Crb1Q8VHS2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Crb1Q8VHS2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Crb1Q8VHS2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Crb1Q8VHS2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Crb1Q8VHS2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Crb1Q8VHS2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Crb1Q8VHS2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Crb1Q8VHS2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Crb1Q8VHS2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Crb1Q8VHS2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Crb1Q8VHS2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Crb1Q8VHS2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Crb1Q8VHS2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Crb1Q8VHS2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Crb1Q8VHS2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Crb1Q8VHS2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Crb1Q8VHS2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Crb1Q8VHS2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Crb1Q8VHS2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Crb1Q8VHS2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Crb1Q8VHS2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Crb1Q8VHS2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Crb1Q8VHS2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Crb1Q8VHS2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Crb1Q8VHS2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Crb1Q8VHS2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Crb1Q8VHS2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Crb1Q8VHS2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Crb1Q8VHS2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Crb1Q8VHS2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Crb1Q8VHS2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Crb1Q8VHS2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Crb1Q8VHS2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Crb1Q8VHS2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Crb1Q8VHS2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Crb1Q8VHS2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Crb1Q8VHS2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Crb1Q8VHS2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Crb1Q8VHS2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Crb1Q8VHS2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Crb1Q8VHS2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Crb1Q8VHS2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Crb1Q8VHS2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Crb1Q8VHS2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Crb1Q8VHS2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Crb1Q8VHS2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Crb1Q8VHS2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Crb1Q8VHS2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Crb1Q8VHS2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Crb1Q8VHS2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Crb1Q8VHS2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Crb1Q8VHS2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Crb1Q8VHS2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Crb1Q8VHS2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Crb1Q8VHS2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Crb1Q8VHS2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Crb1Q8VHS2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Crb1Q8VHS2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Crb1Q8VHS2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Crb1Q8VHS2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Crb1Q8VHS2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Crb1Q8VHS2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Crb1Q8VHS2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Crb1Q8VHS2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Crb1Q8VHS2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Crb1Q8VHS2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Crb1Q8VHS2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Crb1Q8VHS2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms