Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slf1Q8R3P9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slf1Q8R3P9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slf1Q8R3P9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slf1Q8R3P9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slf1Q8R3P9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slf1Q8R3P9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms