Protein–RNA interactions for Protein: Q8K595

Mcoln2, Mucolipin-2, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln2Q8K595 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcoln2Q8K595 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcoln2Q8K595 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcoln2Q8K595 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcoln2Q8K595 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcoln2Q8K595 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mcoln2Q8K595 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mcoln2Q8K595 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mcoln2Q8K595 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mcoln2Q8K595 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mcoln2Q8K595 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mcoln2Q8K595 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mcoln2Q8K595 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mcoln2Q8K595 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mcoln2Q8K595 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mcoln2Q8K595 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Mcoln2Q8K595 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mcoln2Q8K595 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mcoln2Q8K595 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mcoln2Q8K595 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Mcoln2Q8K595 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mcoln2Q8K595 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mcoln2Q8K595 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mcoln2Q8K595 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mcoln2Q8K595 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mcoln2Q8K595 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mcoln2Q8K595 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mcoln2Q8K595 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mcoln2Q8K595 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mcoln2Q8K595 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mcoln2Q8K595 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mcoln2Q8K595 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mcoln2Q8K595 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mcoln2Q8K595 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mcoln2Q8K595 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Mcoln2Q8K595 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mcoln2Q8K595 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mcoln2Q8K595 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mcoln2Q8K595 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mcoln2Q8K595 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mcoln2Q8K595 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mcoln2Q8K595 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mcoln2Q8K595 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mcoln2Q8K595 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mcoln2Q8K595 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mcoln2Q8K595 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mcoln2Q8K595 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Mcoln2Q8K595 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mcoln2Q8K595 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mcoln2Q8K595 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mcoln2Q8K595 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Mcoln2Q8K595 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mcoln2Q8K595 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mcoln2Q8K595 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcoln2Q8K595 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcoln2Q8K595 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcoln2Q8K595 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcoln2Q8K595 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcoln2Q8K595 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcoln2Q8K595 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcoln2Q8K595 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcoln2Q8K595 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcoln2Q8K595 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcoln2Q8K595 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcoln2Q8K595 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcoln2Q8K595 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcoln2Q8K595 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcoln2Q8K595 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcoln2Q8K595 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcoln2Q8K595 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcoln2Q8K595 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcoln2Q8K595 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcoln2Q8K595 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcoln2Q8K595 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcoln2Q8K595 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcoln2Q8K595 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcoln2Q8K595 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcoln2Q8K595 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcoln2Q8K595 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcoln2Q8K595 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcoln2Q8K595 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcoln2Q8K595 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcoln2Q8K595 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcoln2Q8K595 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcoln2Q8K595 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mcoln2Q8K595 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mcoln2Q8K595 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcoln2Q8K595 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcoln2Q8K595 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcoln2Q8K595 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcoln2Q8K595 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcoln2Q8K595 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcoln2Q8K595 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcoln2Q8K595 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcoln2Q8K595 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcoln2Q8K595 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mcoln2Q8K595 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mcoln2Q8K595 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mcoln2Q8K595 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mcoln2Q8K595 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms