Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4K6

Pank1, Pantothenate kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pank1Q8K4K6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pank1Q8K4K6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pank1Q8K4K6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pank1Q8K4K6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pank1Q8K4K6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pank1Q8K4K6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pank1Q8K4K6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pank1Q8K4K6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pank1Q8K4K6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pank1Q8K4K6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pank1Q8K4K6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pank1Q8K4K6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pank1Q8K4K6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pank1Q8K4K6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pank1Q8K4K6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pank1Q8K4K6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pank1Q8K4K6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pank1Q8K4K6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pank1Q8K4K6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pank1Q8K4K6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pank1Q8K4K6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pank1Q8K4K6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pank1Q8K4K6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pank1Q8K4K6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pank1Q8K4K6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pank1Q8K4K6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pank1Q8K4K6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pank1Q8K4K6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pank1Q8K4K6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pank1Q8K4K6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pank1Q8K4K6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pank1Q8K4K6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pank1Q8K4K6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pank1Q8K4K6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pank1Q8K4K6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms