Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkn3Q8K045 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkn3Q8K045 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkn3Q8K045 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkn3Q8K045 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkn3Q8K045 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkn3Q8K045 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkn3Q8K045 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkn3Q8K045 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkn3Q8K045 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkn3Q8K045 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkn3Q8K045 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkn3Q8K045 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pkn3Q8K045 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pkn3Q8K045 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkn3Q8K045 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkn3Q8K045 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkn3Q8K045 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkn3Q8K045 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkn3Q8K045 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkn3Q8K045 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkn3Q8K045 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkn3Q8K045 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkn3Q8K045 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkn3Q8K045 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkn3Q8K045 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkn3Q8K045 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkn3Q8K045 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkn3Q8K045 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkn3Q8K045 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkn3Q8K045 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkn3Q8K045 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkn3Q8K045 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkn3Q8K045 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkn3Q8K045 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkn3Q8K045 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkn3Q8K045 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms