Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc4a8Q8JZR6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc4a8Q8JZR6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc4a8Q8JZR6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc4a8Q8JZR6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc4a8Q8JZR6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc4a8Q8JZR6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc4a8Q8JZR6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc4a8Q8JZR6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Slc4a8Q8JZR6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Slc4a8Q8JZR6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc4a8Q8JZR6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc4a8Q8JZR6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc4a8Q8JZR6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc4a8Q8JZR6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc4a8Q8JZR6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc4a8Q8JZR6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc4a8Q8JZR6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc4a8Q8JZR6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc4a8Q8JZR6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc4a8Q8JZR6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc4a8Q8JZR6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc4a8Q8JZR6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc4a8Q8JZR6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc4a8Q8JZR6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc4a8Q8JZR6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc4a8Q8JZR6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc4a8Q8JZR6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc4a8Q8JZR6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc4a8Q8JZR6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Slc4a8Q8JZR6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc4a8Q8JZR6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc4a8Q8JZR6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms