Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syne4Q8CII8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syne4Q8CII8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syne4Q8CII8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syne4Q8CII8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syne4Q8CII8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syne4Q8CII8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syne4Q8CII8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syne4Q8CII8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Syne4Q8CII8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Syne4Q8CII8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Syne4Q8CII8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Syne4Q8CII8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Syne4Q8CII8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Syne4Q8CII8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syne4Q8CII8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syne4Q8CII8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syne4Q8CII8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syne4Q8CII8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Syne4Q8CII8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Syne4Q8CII8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Syne4Q8CII8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Syne4Q8CII8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Syne4Q8CII8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Syne4Q8CII8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Syne4Q8CII8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Syne4Q8CII8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Syne4Q8CII8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Syne4Q8CII8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Syne4Q8CII8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Syne4Q8CII8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Syne4Q8CII8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Syne4Q8CII8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Syne4Q8CII8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Syne4Q8CII8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Syne4Q8CII8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Syne4Q8CII8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Syne4Q8CII8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Syne4Q8CII8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Syne4Q8CII8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Syne4Q8CII8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Syne4Q8CII8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Syne4Q8CII8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Syne4Q8CII8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Syne4Q8CII8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syne4Q8CII8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syne4Q8CII8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syne4Q8CII8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syne4Q8CII8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syne4Q8CII8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syne4Q8CII8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syne4Q8CII8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Syne4Q8CII8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Syne4Q8CII8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Syne4Q8CII8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Syne4Q8CII8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Syne4Q8CII8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syne4Q8CII8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syne4Q8CII8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syne4Q8CII8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syne4Q8CII8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Syne4Q8CII8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Syne4Q8CII8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syne4Q8CII8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syne4Q8CII8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syne4Q8CII8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syne4Q8CII8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syne4Q8CII8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Syne4Q8CII8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syne4Q8CII8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syne4Q8CII8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syne4Q8CII8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syne4Q8CII8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Syne4Q8CII8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Syne4Q8CII8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Syne4Q8CII8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Syne4Q8CII8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Syne4Q8CII8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Syne4Q8CII8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Syne4Q8CII8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syne4Q8CII8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syne4Q8CII8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syne4Q8CII8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syne4Q8CII8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syne4Q8CII8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syne4Q8CII8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syne4Q8CII8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syne4Q8CII8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syne4Q8CII8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syne4Q8CII8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syne4Q8CII8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syne4Q8CII8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Syne4Q8CII8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Syne4Q8CII8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Syne4Q8CII8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Syne4Q8CII8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Syne4Q8CII8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syne4Q8CII8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syne4Q8CII8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syne4Q8CII8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms