Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEL2

Cfap61, Cilia- and flagella-associated protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 1,252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap61Q8CEL2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap61Q8CEL2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap61Q8CEL2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap61Q8CEL2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap61Q8CEL2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap61Q8CEL2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap61Q8CEL2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap61Q8CEL2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap61Q8CEL2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap61Q8CEL2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap61Q8CEL2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap61Q8CEL2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap61Q8CEL2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap61Q8CEL2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap61Q8CEL2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap61Q8CEL2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap61Q8CEL2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap61Q8CEL2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap61Q8CEL2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap61Q8CEL2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap61Q8CEL2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap61Q8CEL2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap61Q8CEL2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfap61Q8CEL2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfap61Q8CEL2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfap61Q8CEL2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfap61Q8CEL2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfap61Q8CEL2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfap61Q8CEL2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfap61Q8CEL2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfap61Q8CEL2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfap61Q8CEL2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap61Q8CEL2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap61Q8CEL2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap61Q8CEL2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap61Q8CEL2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap61Q8CEL2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap61Q8CEL2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfap61Q8CEL2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfap61Q8CEL2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfap61Q8CEL2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfap61Q8CEL2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap61Q8CEL2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap61Q8CEL2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap61Q8CEL2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap61Q8CEL2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap61Q8CEL2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap61Q8CEL2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap61Q8CEL2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap61Q8CEL2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap61Q8CEL2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap61Q8CEL2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap61Q8CEL2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap61Q8CEL2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap61Q8CEL2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap61Q8CEL2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap61Q8CEL2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap61Q8CEL2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap61Q8CEL2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap61Q8CEL2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap61Q8CEL2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap61Q8CEL2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap61Q8CEL2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap61Q8CEL2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap61Q8CEL2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap61Q8CEL2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap61Q8CEL2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap61Q8CEL2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap61Q8CEL2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap61Q8CEL2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap61Q8CEL2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap61Q8CEL2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap61Q8CEL2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap61Q8CEL2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cfap61Q8CEL2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cfap61Q8CEL2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap61Q8CEL2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap61Q8CEL2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap61Q8CEL2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap61Q8CEL2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap61Q8CEL2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap61Q8CEL2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap61Q8CEL2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap61Q8CEL2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap61Q8CEL2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap61Q8CEL2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap61Q8CEL2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap61Q8CEL2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap61Q8CEL2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap61Q8CEL2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap61Q8CEL2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap61Q8CEL2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap61Q8CEL2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap61Q8CEL2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap61Q8CEL2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap61Q8CEL2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap61Q8CEL2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap61Q8CEL2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap61Q8CEL2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap61Q8CEL2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms