Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp27Q8CEG8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp27Q8CEG8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp27Q8CEG8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp27Q8CEG8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp27Q8CEG8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp27Q8CEG8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp27Q8CEG8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp27Q8CEG8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp27Q8CEG8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp27Q8CEG8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp27Q8CEG8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp27Q8CEG8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp27Q8CEG8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp27Q8CEG8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp27Q8CEG8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp27Q8CEG8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp27Q8CEG8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp27Q8CEG8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp27Q8CEG8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp27Q8CEG8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp27Q8CEG8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp27Q8CEG8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp27Q8CEG8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp27Q8CEG8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp27Q8CEG8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp27Q8CEG8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp27Q8CEG8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp27Q8CEG8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp27Q8CEG8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Usp27Q8CEG8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp27Q8CEG8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp27Q8CEG8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp27Q8CEG8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp27Q8CEG8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp27Q8CEG8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp27Q8CEG8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp27Q8CEG8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp27Q8CEG8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp27Q8CEG8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp27Q8CEG8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp27Q8CEG8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp27Q8CEG8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp27Q8CEG8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp27Q8CEG8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp27Q8CEG8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp27Q8CEG8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp27Q8CEG8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp27Q8CEG8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp27Q8CEG8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp27Q8CEG8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp27Q8CEG8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp27Q8CEG8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Usp27Q8CEG8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp27Q8CEG8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms