Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc15Q8C9M2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc15Q8C9M2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc15Q8C9M2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc15Q8C9M2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc15Q8C9M2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc15Q8C9M2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc15Q8C9M2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc15Q8C9M2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc15Q8C9M2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc15Q8C9M2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc15Q8C9M2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc15Q8C9M2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc15Q8C9M2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc15Q8C9M2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc15Q8C9M2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc15Q8C9M2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc15Q8C9M2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc15Q8C9M2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc15Q8C9M2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc15Q8C9M2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc15Q8C9M2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc15Q8C9M2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc15Q8C9M2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc15Q8C9M2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc15Q8C9M2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc15Q8C9M2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc15Q8C9M2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc15Q8C9M2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc15Q8C9M2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc15Q8C9M2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc15Q8C9M2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc15Q8C9M2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc15Q8C9M2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc15Q8C9M2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc15Q8C9M2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc15Q8C9M2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc15Q8C9M2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc15Q8C9M2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc15Q8C9M2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc15Q8C9M2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc15Q8C9M2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc15Q8C9M2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc15Q8C9M2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc15Q8C9M2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc15Q8C9M2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc15Q8C9M2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc15Q8C9M2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc15Q8C9M2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc15Q8C9M2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc15Q8C9M2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc15Q8C9M2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc15Q8C9M2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc15Q8C9M2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc15Q8C9M2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc15Q8C9M2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc15Q8C9M2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc15Q8C9M2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc15Q8C9M2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc15Q8C9M2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc15Q8C9M2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc15Q8C9M2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc15Q8C9M2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc15Q8C9M2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc15Q8C9M2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc15Q8C9M2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc15Q8C9M2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc15Q8C9M2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc15Q8C9M2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc15Q8C9M2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc15Q8C9M2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc15Q8C9M2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc15Q8C9M2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc15Q8C9M2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc15Q8C9M2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc15Q8C9M2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc15Q8C9M2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc15Q8C9M2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc15Q8C9M2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc15Q8C9M2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc15Q8C9M2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc15Q8C9M2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc15Q8C9M2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc15Q8C9M2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc15Q8C9M2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc15Q8C9M2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc15Q8C9M2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc15Q8C9M2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc15Q8C9M2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc15Q8C9M2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc15Q8C9M2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc15Q8C9M2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc15Q8C9M2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc15Q8C9M2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc15Q8C9M2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc15Q8C9M2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc15Q8C9M2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc15Q8C9M2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc15Q8C9M2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc15Q8C9M2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms