Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9H6

Strip2, Striatin-interacting proteins 2, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip2Q8C9H6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Strip2Q8C9H6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Strip2Q8C9H6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Strip2Q8C9H6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Strip2Q8C9H6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Strip2Q8C9H6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Strip2Q8C9H6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Strip2Q8C9H6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Strip2Q8C9H6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Strip2Q8C9H6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Strip2Q8C9H6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Strip2Q8C9H6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Strip2Q8C9H6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Strip2Q8C9H6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Strip2Q8C9H6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strip2Q8C9H6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Strip2Q8C9H6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strip2Q8C9H6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strip2Q8C9H6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strip2Q8C9H6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strip2Q8C9H6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strip2Q8C9H6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Strip2Q8C9H6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strip2Q8C9H6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strip2Q8C9H6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strip2Q8C9H6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Strip2Q8C9H6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Strip2Q8C9H6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Strip2Q8C9H6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Strip2Q8C9H6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Strip2Q8C9H6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms