Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tsr2Q8C8T8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tsr2Q8C8T8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tsr2Q8C8T8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tsr2Q8C8T8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tsr2Q8C8T8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tsr2Q8C8T8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tsr2Q8C8T8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tsr2Q8C8T8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Tsr2Q8C8T8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Tsr2Q8C8T8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tsr2Q8C8T8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tsr2Q8C8T8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Tsr2Q8C8T8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tsr2Q8C8T8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tsr2Q8C8T8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tsr2Q8C8T8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tsr2Q8C8T8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tsr2Q8C8T8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tsr2Q8C8T8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tsr2Q8C8T8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Tsr2Q8C8T8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tsr2Q8C8T8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tsr2Q8C8T8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tsr2Q8C8T8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Tsr2Q8C8T8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tsr2Q8C8T8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tsr2Q8C8T8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tsr2Q8C8T8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tsr2Q8C8T8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tsr2Q8C8T8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Tsr2Q8C8T8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Tsr2Q8C8T8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tsr2Q8C8T8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tsr2Q8C8T8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tsr2Q8C8T8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tsr2Q8C8T8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tsr2Q8C8T8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tsr2Q8C8T8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tsr2Q8C8T8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tsr2Q8C8T8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tsr2Q8C8T8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tsr2Q8C8T8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tsr2Q8C8T8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tsr2Q8C8T8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tsr2Q8C8T8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tsr2Q8C8T8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tsr2Q8C8T8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tsr2Q8C8T8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tsr2Q8C8T8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tsr2Q8C8T8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tsr2Q8C8T8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Tsr2Q8C8T8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tsr2Q8C8T8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tsr2Q8C8T8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tsr2Q8C8T8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tsr2Q8C8T8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tsr2Q8C8T8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tsr2Q8C8T8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tsr2Q8C8T8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tsr2Q8C8T8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Tsr2Q8C8T8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tsr2Q8C8T8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tsr2Q8C8T8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tsr2Q8C8T8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tsr2Q8C8T8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tsr2Q8C8T8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tsr2Q8C8T8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms