Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K3

Srsf12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf12Q8C8K3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf12Q8C8K3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf12Q8C8K3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf12Q8C8K3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf12Q8C8K3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf12Q8C8K3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf12Q8C8K3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf12Q8C8K3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf12Q8C8K3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf12Q8C8K3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf12Q8C8K3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf12Q8C8K3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf12Q8C8K3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf12Q8C8K3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf12Q8C8K3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf12Q8C8K3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf12Q8C8K3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf12Q8C8K3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf12Q8C8K3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Srsf12Q8C8K3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Srsf12Q8C8K3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Srsf12Q8C8K3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srsf12Q8C8K3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srsf12Q8C8K3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms