Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Dclre1bQ8C7W7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dclre1bQ8C7W7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dclre1bQ8C7W7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dclre1bQ8C7W7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dclre1bQ8C7W7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dclre1bQ8C7W7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dclre1bQ8C7W7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dclre1bQ8C7W7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dclre1bQ8C7W7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dclre1bQ8C7W7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dclre1bQ8C7W7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dclre1bQ8C7W7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dclre1bQ8C7W7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dclre1bQ8C7W7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dclre1bQ8C7W7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Dclre1bQ8C7W7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dclre1bQ8C7W7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dclre1bQ8C7W7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dclre1bQ8C7W7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dclre1bQ8C7W7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dclre1bQ8C7W7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dclre1bQ8C7W7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dclre1bQ8C7W7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dclre1bQ8C7W7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Dclre1bQ8C7W7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dclre1bQ8C7W7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dclre1bQ8C7W7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclre1bQ8C7W7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms