Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7D2

Crbn, Protein cereblon, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrbnQ8C7D2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CrbnQ8C7D2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CrbnQ8C7D2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CrbnQ8C7D2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CrbnQ8C7D2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CrbnQ8C7D2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CrbnQ8C7D2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CrbnQ8C7D2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CrbnQ8C7D2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CrbnQ8C7D2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CrbnQ8C7D2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CrbnQ8C7D2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CrbnQ8C7D2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CrbnQ8C7D2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CrbnQ8C7D2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CrbnQ8C7D2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CrbnQ8C7D2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CrbnQ8C7D2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CrbnQ8C7D2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CrbnQ8C7D2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CrbnQ8C7D2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CrbnQ8C7D2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CrbnQ8C7D2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CrbnQ8C7D2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CrbnQ8C7D2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CrbnQ8C7D2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CrbnQ8C7D2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CrbnQ8C7D2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CrbnQ8C7D2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CrbnQ8C7D2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CrbnQ8C7D2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CrbnQ8C7D2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CrbnQ8C7D2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CrbnQ8C7D2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CrbnQ8C7D2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CrbnQ8C7D2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CrbnQ8C7D2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CrbnQ8C7D2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CrbnQ8C7D2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CrbnQ8C7D2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CrbnQ8C7D2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CrbnQ8C7D2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CrbnQ8C7D2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CrbnQ8C7D2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CrbnQ8C7D2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CrbnQ8C7D2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CrbnQ8C7D2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CrbnQ8C7D2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CrbnQ8C7D2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CrbnQ8C7D2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CrbnQ8C7D2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CrbnQ8C7D2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CrbnQ8C7D2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CrbnQ8C7D2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CrbnQ8C7D2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CrbnQ8C7D2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CrbnQ8C7D2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CrbnQ8C7D2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CrbnQ8C7D2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CrbnQ8C7D2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CrbnQ8C7D2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CrbnQ8C7D2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CrbnQ8C7D2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CrbnQ8C7D2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CrbnQ8C7D2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CrbnQ8C7D2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
CrbnQ8C7D2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CrbnQ8C7D2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CrbnQ8C7D2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CrbnQ8C7D2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CrbnQ8C7D2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CrbnQ8C7D2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CrbnQ8C7D2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CrbnQ8C7D2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CrbnQ8C7D2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CrbnQ8C7D2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CrbnQ8C7D2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CrbnQ8C7D2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CrbnQ8C7D2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CrbnQ8C7D2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CrbnQ8C7D2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CrbnQ8C7D2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CrbnQ8C7D2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CrbnQ8C7D2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CrbnQ8C7D2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CrbnQ8C7D2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CrbnQ8C7D2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CrbnQ8C7D2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CrbnQ8C7D2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CrbnQ8C7D2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CrbnQ8C7D2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CrbnQ8C7D2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CrbnQ8C7D2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CrbnQ8C7D2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CrbnQ8C7D2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CrbnQ8C7D2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CrbnQ8C7D2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CrbnQ8C7D2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CrbnQ8C7D2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CrbnQ8C7D2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.2 ms