Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp4bQ8C6J9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp4bQ8C6J9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp4bQ8C6J9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp4bQ8C6J9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp4bQ8C6J9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp4bQ8C6J9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp4bQ8C6J9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp4bQ8C6J9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp4bQ8C6J9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp4bQ8C6J9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp4bQ8C6J9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp4bQ8C6J9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp4bQ8C6J9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp4bQ8C6J9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp4bQ8C6J9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp4bQ8C6J9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp4bQ8C6J9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp4bQ8C6J9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp4bQ8C6J9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp4bQ8C6J9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp4bQ8C6J9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp4bQ8C6J9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp4bQ8C6J9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp4bQ8C6J9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp4bQ8C6J9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp4bQ8C6J9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp4bQ8C6J9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp4bQ8C6J9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp4bQ8C6J9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp4bQ8C6J9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp4bQ8C6J9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp4bQ8C6J9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp4bQ8C6J9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp4bQ8C6J9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp4bQ8C6J9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp4bQ8C6J9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp4bQ8C6J9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp4bQ8C6J9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp4bQ8C6J9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp4bQ8C6J9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp4bQ8C6J9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp4bQ8C6J9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp4bQ8C6J9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp4bQ8C6J9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp4bQ8C6J9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp4bQ8C6J9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp4bQ8C6J9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp4bQ8C6J9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp4bQ8C6J9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp4bQ8C6J9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp4bQ8C6J9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp4bQ8C6J9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp4bQ8C6J9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nlrp4bQ8C6J9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp4bQ8C6J9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp4bQ8C6J9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp4bQ8C6J9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp4bQ8C6J9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp4bQ8C6J9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp4bQ8C6J9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp4bQ8C6J9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp4bQ8C6J9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp4bQ8C6J9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp4bQ8C6J9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp4bQ8C6J9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms