Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4933409G03RikQ8C5U0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933409G03RikQ8C5U0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4933409G03RikQ8C5U0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
4933409G03RikQ8C5U0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4933409G03RikQ8C5U0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
4933409G03RikQ8C5U0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4933409G03RikQ8C5U0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4933409G03RikQ8C5U0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4933409G03RikQ8C5U0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
4933409G03RikQ8C5U0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
4933409G03RikQ8C5U0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4933409G03RikQ8C5U0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4933409G03RikQ8C5U0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4933409G03RikQ8C5U0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4933409G03RikQ8C5U0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
4933409G03RikQ8C5U0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4933409G03RikQ8C5U0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
4933409G03RikQ8C5U0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4933409G03RikQ8C5U0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4933409G03RikQ8C5U0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
4933409G03RikQ8C5U0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4933409G03RikQ8C5U0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4933409G03RikQ8C5U0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4933409G03RikQ8C5U0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
4933409G03RikQ8C5U0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4933409G03RikQ8C5U0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4933409G03RikQ8C5U0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4933409G03RikQ8C5U0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4933409G03RikQ8C5U0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
4933409G03RikQ8C5U0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
4933409G03RikQ8C5U0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
4933409G03RikQ8C5U0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4933409G03RikQ8C5U0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4933409G03RikQ8C5U0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4933409G03RikQ8C5U0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933409G03RikQ8C5U0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933409G03RikQ8C5U0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933409G03RikQ8C5U0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933409G03RikQ8C5U0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933409G03RikQ8C5U0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933409G03RikQ8C5U0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933409G03RikQ8C5U0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933409G03RikQ8C5U0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
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4933409G03RikQ8C5U0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4933409G03RikQ8C5U0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4933409G03RikQ8C5U0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4933409G03RikQ8C5U0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4933409G03RikQ8C5U0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4933409G03RikQ8C5U0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4933409G03RikQ8C5U0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4933409G03RikQ8C5U0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
4933409G03RikQ8C5U0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4933409G03RikQ8C5U0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4933409G03RikQ8C5U0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4933409G03RikQ8C5U0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4933409G03RikQ8C5U0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
4933409G03RikQ8C5U0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
4933409G03RikQ8C5U0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
4933409G03RikQ8C5U0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
4933409G03RikQ8C5U0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4933409G03RikQ8C5U0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4933409G03RikQ8C5U0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4933409G03RikQ8C5U0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4933409G03RikQ8C5U0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4933409G03RikQ8C5U0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4933409G03RikQ8C5U0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4933409G03RikQ8C5U0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
4933409G03RikQ8C5U0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
4933409G03RikQ8C5U0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
4933409G03RikQ8C5U0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4933409G03RikQ8C5U0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4933409G03RikQ8C5U0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
4933409G03RikQ8C5U0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4933409G03RikQ8C5U0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4933409G03RikQ8C5U0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4933409G03RikQ8C5U0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
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