Protein–RNA interactions for Protein: Q8C267

Setdb2, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB2, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb2Q8C267 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Setdb2Q8C267 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Setdb2Q8C267 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Setdb2Q8C267 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Setdb2Q8C267 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Setdb2Q8C267 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Setdb2Q8C267 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Setdb2Q8C267 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Setdb2Q8C267 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setdb2Q8C267 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setdb2Q8C267 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Setdb2Q8C267 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Setdb2Q8C267 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Setdb2Q8C267 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Setdb2Q8C267 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Setdb2Q8C267 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Setdb2Q8C267 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Setdb2Q8C267 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Setdb2Q8C267 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Setdb2Q8C267 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Setdb2Q8C267 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setdb2Q8C267 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setdb2Q8C267 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setdb2Q8C267 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setdb2Q8C267 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setdb2Q8C267 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setdb2Q8C267 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setdb2Q8C267 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setdb2Q8C267 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setdb2Q8C267 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setdb2Q8C267 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setdb2Q8C267 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setdb2Q8C267 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Setdb2Q8C267 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Setdb2Q8C267 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setdb2Q8C267 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setdb2Q8C267 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setdb2Q8C267 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setdb2Q8C267 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setdb2Q8C267 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setdb2Q8C267 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setdb2Q8C267 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setdb2Q8C267 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setdb2Q8C267 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setdb2Q8C267 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setdb2Q8C267 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setdb2Q8C267 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setdb2Q8C267 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setdb2Q8C267 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setdb2Q8C267 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setdb2Q8C267 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setdb2Q8C267 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setdb2Q8C267 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setdb2Q8C267 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setdb2Q8C267 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setdb2Q8C267 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Setdb2Q8C267 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setdb2Q8C267 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setdb2Q8C267 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Setdb2Q8C267 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Setdb2Q8C267 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Setdb2Q8C267 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Setdb2Q8C267 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Setdb2Q8C267 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms