Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trerf1Q8BXJ2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trerf1Q8BXJ2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trerf1Q8BXJ2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trerf1Q8BXJ2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trerf1Q8BXJ2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trerf1Q8BXJ2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trerf1Q8BXJ2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trerf1Q8BXJ2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trerf1Q8BXJ2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trerf1Q8BXJ2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trerf1Q8BXJ2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trerf1Q8BXJ2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trerf1Q8BXJ2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trerf1Q8BXJ2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trerf1Q8BXJ2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trerf1Q8BXJ2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trerf1Q8BXJ2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trerf1Q8BXJ2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trerf1Q8BXJ2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trerf1Q8BXJ2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trerf1Q8BXJ2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trerf1Q8BXJ2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trerf1Q8BXJ2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trerf1Q8BXJ2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trerf1Q8BXJ2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trerf1Q8BXJ2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trerf1Q8BXJ2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trerf1Q8BXJ2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trerf1Q8BXJ2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trerf1Q8BXJ2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trerf1Q8BXJ2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trerf1Q8BXJ2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trerf1Q8BXJ2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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