Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Tnrc6bQ8BKI2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Tnrc6bQ8BKI2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Tnrc6bQ8BKI2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tnrc6bQ8BKI2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tnrc6bQ8BKI2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tnrc6bQ8BKI2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tnrc6bQ8BKI2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Tnrc6bQ8BKI2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Tnrc6bQ8BKI2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Tnrc6bQ8BKI2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Tnrc6bQ8BKI2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Tnrc6bQ8BKI2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Tnrc6bQ8BKI2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Tnrc6bQ8BKI2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Tnrc6bQ8BKI2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Tnrc6bQ8BKI2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Tnrc6bQ8BKI2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Tnrc6bQ8BKI2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Tnrc6bQ8BKI2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Tnrc6bQ8BKI2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Tnrc6bQ8BKI2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Tnrc6bQ8BKI2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Tnrc6bQ8BKI2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Tnrc6bQ8BKI2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Tnrc6bQ8BKI2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tnrc6bQ8BKI2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tnrc6bQ8BKI2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tnrc6bQ8BKI2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tnrc6bQ8BKI2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tnrc6bQ8BKI2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tnrc6bQ8BKI2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Tnrc6bQ8BKI2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Tnrc6bQ8BKI2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Tnrc6bQ8BKI2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tnrc6bQ8BKI2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tnrc6bQ8BKI2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tnrc6bQ8BKI2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tnrc6bQ8BKI2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tnrc6bQ8BKI2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Tnrc6bQ8BKI2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Tnrc6bQ8BKI2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Tnrc6bQ8BKI2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Tnrc6bQ8BKI2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Tnrc6bQ8BKI2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Tnrc6bQ8BKI2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Tnrc6bQ8BKI2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Tnrc6bQ8BKI2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Tnrc6bQ8BKI2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Tnrc6bQ8BKI2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Tnrc6bQ8BKI2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tnrc6bQ8BKI2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tnrc6bQ8BKI2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tnrc6bQ8BKI2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tnrc6bQ8BKI2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tnrc6bQ8BKI2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tnrc6bQ8BKI2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Tnrc6bQ8BKI2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Tnrc6bQ8BKI2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tnrc6bQ8BKI2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tnrc6bQ8BKI2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Tnrc6bQ8BKI2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Tnrc6bQ8BKI2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tnrc6bQ8BKI2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tnrc6bQ8BKI2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tnrc6bQ8BKI2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tnrc6bQ8BKI2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Tnrc6bQ8BKI2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Tnrc6bQ8BKI2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Tnrc6bQ8BKI2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Tnrc6bQ8BKI2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tnrc6bQ8BKI2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tnrc6bQ8BKI2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tnrc6bQ8BKI2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Tnrc6bQ8BKI2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Tnrc6bQ8BKI2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tnrc6bQ8BKI2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tnrc6bQ8BKI2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Tnrc6bQ8BKI2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Tnrc6bQ8BKI2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Tnrc6bQ8BKI2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Tnrc6bQ8BKI2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms