Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX0

4933402J07Rik, RIKEN cDNA 4933402J07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402J07RikQ8BHX0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933402J07RikQ8BHX0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
4933402J07RikQ8BHX0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933402J07RikQ8BHX0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933402J07RikQ8BHX0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933402J07RikQ8BHX0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
4933402J07RikQ8BHX0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933402J07RikQ8BHX0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933402J07RikQ8BHX0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933402J07RikQ8BHX0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933402J07RikQ8BHX0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933402J07RikQ8BHX0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933402J07RikQ8BHX0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933402J07RikQ8BHX0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
4933402J07RikQ8BHX0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933402J07RikQ8BHX0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933402J07RikQ8BHX0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933402J07RikQ8BHX0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933402J07RikQ8BHX0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933402J07RikQ8BHX0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933402J07RikQ8BHX0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933402J07RikQ8BHX0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933402J07RikQ8BHX0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4933402J07RikQ8BHX0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
4933402J07RikQ8BHX0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4933402J07RikQ8BHX0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
4933402J07RikQ8BHX0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4933402J07RikQ8BHX0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4933402J07RikQ8BHX0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933402J07RikQ8BHX0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
4933402J07RikQ8BHX0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4933402J07RikQ8BHX0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4933402J07RikQ8BHX0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
4933402J07RikQ8BHX0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4933402J07RikQ8BHX0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4933402J07RikQ8BHX0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4933402J07RikQ8BHX0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4933402J07RikQ8BHX0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933402J07RikQ8BHX0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933402J07RikQ8BHX0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933402J07RikQ8BHX0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933402J07RikQ8BHX0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933402J07RikQ8BHX0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933402J07RikQ8BHX0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933402J07RikQ8BHX0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933402J07RikQ8BHX0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933402J07RikQ8BHX0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933402J07RikQ8BHX0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933402J07RikQ8BHX0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4933402J07RikQ8BHX0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
4933402J07RikQ8BHX0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4933402J07RikQ8BHX0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4933402J07RikQ8BHX0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933402J07RikQ8BHX0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms