Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-M10.2Q85ZW9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-M10.2Q85ZW9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-M10.2Q85ZW9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-M10.2Q85ZW9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-M10.2Q85ZW9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-M10.2Q85ZW9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-M10.2Q85ZW9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-M10.2Q85ZW9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
H2-M10.2Q85ZW9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-M10.2Q85ZW9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-M10.2Q85ZW9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-M10.2Q85ZW9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-M10.2Q85ZW9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-M10.2Q85ZW9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-M10.2Q85ZW9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-M10.2Q85ZW9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-M10.2Q85ZW9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-M10.2Q85ZW9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-M10.2Q85ZW9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-M10.2Q85ZW9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-M10.2Q85ZW9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-M10.2Q85ZW9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-M10.2Q85ZW9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-M10.2Q85ZW9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-M10.2Q85ZW9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-M10.2Q85ZW9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-M10.2Q85ZW9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-M10.2Q85ZW9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-M10.2Q85ZW9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2-M10.2Q85ZW9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2-M10.2Q85ZW9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2-M10.2Q85ZW9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2-M10.2Q85ZW9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms