Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Kdm5bQ80Y84 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Kdm5bQ80Y84 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Kdm5bQ80Y84 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Kdm5bQ80Y84 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Kdm5bQ80Y84 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Kdm5bQ80Y84 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Kdm5bQ80Y84 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Kdm5bQ80Y84 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Kdm5bQ80Y84 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Kdm5bQ80Y84 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Kdm5bQ80Y84 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Kdm5bQ80Y84 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Kdm5bQ80Y84 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Kdm5bQ80Y84 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Kdm5bQ80Y84 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Kdm5bQ80Y84 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Kdm5bQ80Y84 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Kdm5bQ80Y84 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Kdm5bQ80Y84 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Kdm5bQ80Y84 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Kdm5bQ80Y84 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Kdm5bQ80Y84 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Kdm5bQ80Y84 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Kdm5bQ80Y84 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Kdm5bQ80Y84 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Kdm5bQ80Y84 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Kdm5bQ80Y84 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Kdm5bQ80Y84 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Kdm5bQ80Y84 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Kdm5bQ80Y84 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Kdm5bQ80Y84 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Kdm5bQ80Y84 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Kdm5bQ80Y84 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Kdm5bQ80Y84 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Kdm5bQ80Y84 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
Kdm5bQ80Y84 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
Kdm5bQ80Y84 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Kdm5bQ80Y84 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Kdm5bQ80Y84 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Kdm5bQ80Y84 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Kdm5bQ80Y84 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Kdm5bQ80Y84 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Kdm5bQ80Y84 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Kdm5bQ80Y84 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Kdm5bQ80Y84 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Kdm5bQ80Y84 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Kdm5bQ80Y84 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Kdm5bQ80Y84 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Kdm5bQ80Y84 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Kdm5bQ80Y84 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Kdm5bQ80Y84 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Kdm5bQ80Y84 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Kdm5bQ80Y84 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Kdm5bQ80Y84 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Kdm5bQ80Y84 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Kdm5bQ80Y84 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Kdm5bQ80Y84 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Kdm5bQ80Y84 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Kdm5bQ80Y84 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Kdm5bQ80Y84 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Kdm5bQ80Y84 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Kdm5bQ80Y84 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Kdm5bQ80Y84 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Kdm5bQ80Y84 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Kdm5bQ80Y84 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Kdm5bQ80Y84 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Kdm5bQ80Y84 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Kdm5bQ80Y84 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Kdm5bQ80Y84 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Kdm5bQ80Y84 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Kdm5bQ80Y84 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Kdm5bQ80Y84 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Kdm5bQ80Y84 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Kdm5bQ80Y84 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Kdm5bQ80Y84 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Kdm5bQ80Y84 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Kdm5bQ80Y84 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Kdm5bQ80Y84 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Kdm5bQ80Y84 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Kdm5bQ80Y84 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Kdm5bQ80Y84 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Kdm5bQ80Y84 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Kdm5bQ80Y84 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Kdm5bQ80Y84 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Kdm5bQ80Y84 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Kdm5bQ80Y84 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Kdm5bQ80Y84 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Kdm5bQ80Y84 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Kdm5bQ80Y84 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Kdm5bQ80Y84 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Kdm5bQ80Y84 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Kdm5bQ80Y84 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Kdm5bQ80Y84 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Kdm5bQ80Y84 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Kdm5bQ80Y84 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Kdm5bQ80Y84 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Kdm5bQ80Y84 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Kdm5bQ80Y84 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Kdm5bQ80Y84 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.7 ms