Protein–RNA interactions for Protein: Q80VL1

Tdrkh, Tudor and KH domain-containing protein, mousemouse

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Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdrkhQ80VL1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TdrkhQ80VL1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TdrkhQ80VL1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TdrkhQ80VL1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TdrkhQ80VL1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TdrkhQ80VL1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TdrkhQ80VL1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TdrkhQ80VL1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TdrkhQ80VL1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TdrkhQ80VL1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TdrkhQ80VL1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TdrkhQ80VL1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TdrkhQ80VL1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TdrkhQ80VL1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TdrkhQ80VL1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TdrkhQ80VL1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TdrkhQ80VL1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TdrkhQ80VL1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TdrkhQ80VL1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TdrkhQ80VL1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TdrkhQ80VL1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TdrkhQ80VL1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TdrkhQ80VL1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TdrkhQ80VL1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TdrkhQ80VL1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TdrkhQ80VL1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TdrkhQ80VL1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TdrkhQ80VL1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TdrkhQ80VL1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TdrkhQ80VL1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TdrkhQ80VL1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TdrkhQ80VL1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TdrkhQ80VL1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TdrkhQ80VL1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TdrkhQ80VL1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TdrkhQ80VL1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TdrkhQ80VL1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TdrkhQ80VL1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TdrkhQ80VL1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TdrkhQ80VL1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TdrkhQ80VL1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TdrkhQ80VL1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TdrkhQ80VL1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TdrkhQ80VL1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TdrkhQ80VL1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TdrkhQ80VL1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TdrkhQ80VL1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TdrkhQ80VL1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TdrkhQ80VL1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TdrkhQ80VL1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TdrkhQ80VL1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TdrkhQ80VL1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TdrkhQ80VL1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TdrkhQ80VL1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TdrkhQ80VL1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TdrkhQ80VL1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TdrkhQ80VL1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TdrkhQ80VL1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TdrkhQ80VL1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TdrkhQ80VL1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TdrkhQ80VL1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TdrkhQ80VL1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TdrkhQ80VL1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TdrkhQ80VL1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TdrkhQ80VL1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TdrkhQ80VL1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TdrkhQ80VL1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TdrkhQ80VL1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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