Protein–RNA interactions for Protein: Q80V62

Fancd2, Fanconi anemia group D2 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fancd2Q80V62 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Fancd2Q80V62 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Fancd2Q80V62 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Fancd2Q80V62 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Fancd2Q80V62 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Fancd2Q80V62 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Fancd2Q80V62 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Fancd2Q80V62 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Fancd2Q80V62 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Fancd2Q80V62 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Fancd2Q80V62 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Fancd2Q80V62 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Fancd2Q80V62 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Fancd2Q80V62 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Fancd2Q80V62 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Fancd2Q80V62 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Fancd2Q80V62 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Fancd2Q80V62 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Fancd2Q80V62 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Fancd2Q80V62 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Fancd2Q80V62 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Fancd2Q80V62 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Fancd2Q80V62 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Fancd2Q80V62 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Fancd2Q80V62 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Fancd2Q80V62 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Fancd2Q80V62 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Fancd2Q80V62 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Fancd2Q80V62 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Fancd2Q80V62 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Fancd2Q80V62 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Fancd2Q80V62 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Fancd2Q80V62 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Fancd2Q80V62 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Fancd2Q80V62 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Fancd2Q80V62 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Fancd2Q80V62 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Fancd2Q80V62 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Fancd2Q80V62 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Fancd2Q80V62 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Fancd2Q80V62 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Fancd2Q80V62 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Fancd2Q80V62 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Fancd2Q80V62 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Fancd2Q80V62 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Fancd2Q80V62 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Fancd2Q80V62 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Fancd2Q80V62 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Fancd2Q80V62 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Fancd2Q80V62 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Fancd2Q80V62 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Fancd2Q80V62 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Fancd2Q80V62 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Fancd2Q80V62 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Fancd2Q80V62 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Fancd2Q80V62 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Fancd2Q80V62 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Fancd2Q80V62 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Fancd2Q80V62 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Fancd2Q80V62 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Fancd2Q80V62 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Fancd2Q80V62 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Fancd2Q80V62 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Fancd2Q80V62 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Fancd2Q80V62 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Fancd2Q80V62 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Fancd2Q80V62 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Fancd2Q80V62 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Fancd2Q80V62 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Fancd2Q80V62 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Fancd2Q80V62 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Fancd2Q80V62 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Fancd2Q80V62 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Fancd2Q80V62 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Fancd2Q80V62 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Fancd2Q80V62 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Fancd2Q80V62 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Fancd2Q80V62 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Fancd2Q80V62 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fancd2Q80V62 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fancd2Q80V62 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fancd2Q80V62 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fancd2Q80V62 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Fancd2Q80V62 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Fancd2Q80V62 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Fancd2Q80V62 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Fancd2Q80V62 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Fancd2Q80V62 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Fancd2Q80V62 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Fancd2Q80V62 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Fancd2Q80V62 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Fancd2Q80V62 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Fancd2Q80V62 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Fancd2Q80V62 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Fancd2Q80V62 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Fancd2Q80V62 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Fancd2Q80V62 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Fancd2Q80V62 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Fancd2Q80V62 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Fancd2Q80V62 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms