Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna12Q80SS5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ifna12Q80SS5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna12Q80SS5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms