Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY6

Celf4, CUGBP Elav-like family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf4Q7TSY6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Celf4Q7TSY6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Celf4Q7TSY6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Celf4Q7TSY6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Celf4Q7TSY6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Celf4Q7TSY6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Celf4Q7TSY6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Celf4Q7TSY6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Celf4Q7TSY6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Celf4Q7TSY6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Celf4Q7TSY6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Celf4Q7TSY6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Celf4Q7TSY6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Celf4Q7TSY6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Celf4Q7TSY6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Celf4Q7TSY6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Celf4Q7TSY6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Celf4Q7TSY6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Celf4Q7TSY6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Celf4Q7TSY6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Celf4Q7TSY6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Celf4Q7TSY6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Celf4Q7TSY6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Celf4Q7TSY6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Celf4Q7TSY6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Celf4Q7TSY6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Celf4Q7TSY6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Celf4Q7TSY6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Celf4Q7TSY6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Celf4Q7TSY6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Celf4Q7TSY6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Celf4Q7TSY6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Celf4Q7TSY6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Celf4Q7TSY6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Celf4Q7TSY6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Celf4Q7TSY6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Celf4Q7TSY6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Celf4Q7TSY6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Celf4Q7TSY6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Celf4Q7TSY6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Celf4Q7TSY6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Celf4Q7TSY6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Celf4Q7TSY6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Celf4Q7TSY6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Celf4Q7TSY6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Celf4Q7TSY6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Celf4Q7TSY6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Celf4Q7TSY6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Celf4Q7TSY6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Celf4Q7TSY6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Celf4Q7TSY6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Celf4Q7TSY6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Celf4Q7TSY6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Celf4Q7TSY6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Celf4Q7TSY6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Celf4Q7TSY6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Celf4Q7TSY6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Celf4Q7TSY6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Celf4Q7TSY6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Celf4Q7TSY6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Celf4Q7TSY6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Celf4Q7TSY6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Celf4Q7TSY6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Celf4Q7TSY6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Celf4Q7TSY6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Celf4Q7TSY6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Celf4Q7TSY6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.9 ms