Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dsg1cQ7TSF0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dsg1cQ7TSF0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.4 ms