Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim17Q7TPM3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim17Q7TPM3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim17Q7TPM3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim17Q7TPM3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim17Q7TPM3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim17Q7TPM3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim17Q7TPM3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim17Q7TPM3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim17Q7TPM3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim17Q7TPM3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim17Q7TPM3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim17Q7TPM3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim17Q7TPM3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim17Q7TPM3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim17Q7TPM3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim17Q7TPM3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim17Q7TPM3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim17Q7TPM3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim17Q7TPM3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim17Q7TPM3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim17Q7TPM3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim17Q7TPM3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim17Q7TPM3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim17Q7TPM3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim17Q7TPM3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim17Q7TPM3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim17Q7TPM3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim17Q7TPM3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim17Q7TPM3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim17Q7TPM3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim17Q7TPM3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim17Q7TPM3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim17Q7TPM3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim17Q7TPM3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim17Q7TPM3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim17Q7TPM3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim17Q7TPM3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim17Q7TPM3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim17Q7TPM3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim17Q7TPM3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim17Q7TPM3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim17Q7TPM3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim17Q7TPM3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim17Q7TPM3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim17Q7TPM3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim17Q7TPM3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim17Q7TPM3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim17Q7TPM3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim17Q7TPM3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim17Q7TPM3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim17Q7TPM3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim17Q7TPM3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim17Q7TPM3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim17Q7TPM3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim17Q7TPM3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim17Q7TPM3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim17Q7TPM3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim17Q7TPM3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim17Q7TPM3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim17Q7TPM3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim17Q7TPM3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim17Q7TPM3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim17Q7TPM3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim17Q7TPM3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim17Q7TPM3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim17Q7TPM3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim17Q7TPM3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim17Q7TPM3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms