Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp397Q7TNK4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp397Q7TNK4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp397Q7TNK4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp397Q7TNK4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp397Q7TNK4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp397Q7TNK4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp397Q7TNK4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp397Q7TNK4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp397Q7TNK4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp397Q7TNK4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp397Q7TNK4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp397Q7TNK4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp397Q7TNK4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp397Q7TNK4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp397Q7TNK4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp397Q7TNK4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp397Q7TNK4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp397Q7TNK4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp397Q7TNK4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp397Q7TNK4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp397Q7TNK4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp397Q7TNK4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp397Q7TNK4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp397Q7TNK4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp397Q7TNK4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp397Q7TNK4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp397Q7TNK4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp397Q7TNK4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp397Q7TNK4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp397Q7TNK4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp397Q7TNK4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp397Q7TNK4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp397Q7TNK4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp397Q7TNK4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp397Q7TNK4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp397Q7TNK4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp397Q7TNK4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp397Q7TNK4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp397Q7TNK4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp397Q7TNK4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp397Q7TNK4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp397Q7TNK4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp397Q7TNK4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp397Q7TNK4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp397Q7TNK4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp397Q7TNK4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp397Q7TNK4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp397Q7TNK4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp397Q7TNK4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zfp397Q7TNK4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zfp397Q7TNK4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zfp397Q7TNK4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfp397Q7TNK4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfp397Q7TNK4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfp397Q7TNK4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfp397Q7TNK4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfp397Q7TNK4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp397Q7TNK4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp397Q7TNK4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp397Q7TNK4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp397Q7TNK4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp397Q7TNK4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp397Q7TNK4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfp397Q7TNK4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfp397Q7TNK4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfp397Q7TNK4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfp397Q7TNK4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfp397Q7TNK4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms